如何在内存中存储分子？
我想将分子存储在记忆中。 这些可以是简单的分子：
Methane (CH4) CH bond-length: 108.7 pm HH angle: 109 degrees 但也有更复杂的分子，如扑热息痛（C8H9NO2）： 
如何将分子存储在内存中，包括所有键长和角度？
将atom-structs存储在数组中的好主意？ 或者，还有更好的方法？
它看起来像某种图形数据结构：
- 分子有一组primefaces
- primefaces通过债券联系在一起：
- 债券可以是双重，单一或三重
- 债券有一定的长度
- 债券有一个角度
- 这是一个循环图（例如，问题中的例子有一个交替的单键和双键环）
- 它不是有向图（如果有两个primefaces键合在一起，那么从哪个端接近键无关紧要）
通常，您将图形存储为节点（primefaces）数组和边数组（键）。 节点和边都是结构的指针。
节点（atom）将存储该元素。
边（键）将存储以下字段：
- 一对指向节点的指针
- 债券类型（双/单）
- 键长和角度
由于它不是有向图，因此您的数据结构会认为A和B之间的边等于B和A之间的边。也就是说，对于给定的primefaces对，您希望边数组包含边从A到B，从不从B到A.
鉴于您正在建模链接结构，似乎链接数据结构将是最合适的表示。 我担心我不足以猜测所有可能存储每个项目的数据的化学家。
另外，它听起来很像你通常存储图形的一个非常轻微的修改版本 – 节点和链接，以及与每个图形相关联的数据。 在图表中，与链接相关联的典型数据是该链接的“成本”，但在这种情况下，它听起来像是存储向量（角度和长度）。
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您是要对这些分子进行任何类型的计算，还是只是绘制它们？ 如果您打算进行任何严格的计算，那么我甚至不会尝试使用Objective C.为了获得最佳性能，您应该将角度，长度和连接存储在正常数组中，并执行必要的所有会计以跟踪什么是什么。 如果涉及大量计算，那些使用花哨的数据结构以及保持分子信息的应用程序运行非常差。
您发布的分子是描述符，如混凝土分子实例的模板（具有不同的笛卡尔坐标）。 因此，对于每种可能数量的分子类型实例，您只需要一个“分子”。 然后，您需要一个坐标数组，您可以从中提取哪个坐标给出一个分子。 对于此单个描述符，您应该创建允许您以尽可能最佳方式访问值的数据结构。 也许是（a，b，r，type）的矢量 – 用于债券的结构，用于角度等的（a，b，c，w，类型）的矢量 。
问候
RBO