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可以从C或Fortran读取.Rdata文件格式吗?

我正在C上写一些R扩展(从R调用C函数)。 我的代码需要同时使用2个不同的数据集来计算统计量,我需要使用所有可能的对组合来执行此操作。 然后,我需要所有这些统计信息(非常大的数组)来继续C侧的计算。 这些文件非常大,通常约为40GB,这就是我的问题。 要在R调用的C上执行此操作,首先我需要加载R中的所有数据集以将它们传递给C函数调用。 但是,理想情况下,如果我能够直接从C或Fortran访问数据集,则可以按顺序在内存中同时维护这些文件中的2个: open file1 – open file2 – compute cov(1,2) close file2 hold file1 – open file3 – compute cov(1,3) … // same approach 这在R上很好,因为我可以加载/卸载文件,但是在调用C或Fortran时我没有任何加载/卸载文件的机制。 所以,我的问题是, 我可以直接从Fortran或C读取.Rdata文件,能够打开/关闭它们吗? 问题的任何其他方法? 据我所知,答案是否定的。 所以,我正在考虑从Rdata迁移到HDF5。