Tag: r
我们可以将Rcpp与多个C ++函数一起使用吗？
我用.c语言构建自己的函数。 然后，我使用.C来编写一个R函数来调用.c函数，例如， tmp <- .C("myfunction", as.integer(N), as.integer(n), as.integer(w1), as.integer(w2), as.integer(w3), PACKAGE = "mypackage")[[3]] 这被称为包裹Rfunction。 此外，我的function基于或要求其他.cfunction。 据我所知，使用Rcpp使它更Rcpp ，更容易，这样： cppFunction(‘int add(int x, int y, int z) { int sum = x + y + z; return sum; }’) 我也知道cppFunction适用于C++语言。 但是，我发现.c函数和.c++之间没有太大区别。 我的问题是：我可以将cppFunction与我的.c函数一起使用requrie wraper R函数吗？ 或者我需要先将.c函数转换为.c++函数？ 那么我的function所基于的其他function呢？ 这会像任何常规的R函数一样吗？ 我的意思是：假设我有两个cppFunction函数myfunc1和myfunc2 ，其中myfunc2基于myfunc1 。 然后假设我的第二个cppFunction如下： cppFunction(‘int myfunc2(int x, int y, int z) […]
使用.call（）将dataframe从-R传递到R和C.
是否有通用方法将具有任意列（整数/因子，数字，字符数据）的dataframe从r传递回c并返回？ 非常感谢能够关闭足够示例的指针。 谢谢。 RT
在R中抑制C警告消息
我从R包e1071调用一个R函数，它与libsvm（一个C程序）接口。 此函数将C（printf）警告消息传递给R控制台。 我知道这是因为警告消息的forms（警告：……）而R警告消息是大写的（即警告：……）。 我已经尝试了一切来摆脱R中的这些消息（下沉，抑制警告，看不见），但似乎没有任何效果。 有任何想法吗？ 谢谢！
如何从R调用C函数？
如何使用R数据从R级使用C编写的某些函数。 例如。 使用如下function： double* addOneToVector(int n, const double* vector) { double* ans = malloc(sizeof(double)*n); for (int i = 0; i < n; ++i) ans[i] = vector[i] + 1 return ans; } 在上下文中： x = 1:3 x = addOneToVector(x) x # 2, 3, 4
R包与C / C ++和openMP：如何在“mypackage / src /”文件夹下制作“Makevars”文件？
我正在使用一些低级C/C++代码和openMP支持在Mac OSX上开发R包。 C++代码是使用Rcpp包编写的。 我的全局”Makevars”文件放在~/.R/文件夹下。 该文件如下所示。 CC=clang-omp CXX=clang-omp++ PKG_CFLAGS=Wall -pedantic PKG_CFLAGS= -fopenmp PKG_CXXFLAGS= -fopenmp PKG_LIBS= -fopenmp -lgomp 在这种配置下一切都很棒！ 但是，现在我想为自己的编译构建特定于包的Makevars文件，以使包可移植。 我尝试的只是将全局Makevars文件移动到我的R pakcage src文件夹中。 但是，编译器抱怨它无法找到openMP头文件omp.h ： ** libs clang++ -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include -I”/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rcpp/include” -I”/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/bigmemory/include” -I”/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/BH/include” -fopenmp -fPIC -Wall -mtune=core2 -g -O2 -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o RcppExports.cpp:12:10: fatal error: ‘omp.h’ file not found #include ^ 1 error […]
使用Rcpp中其他包的C函数
我正在尝试从c ++函数中的cubature包调用C例程来执行多维集成。 我试图重现的基本R例子是 library(cubature) integrand <- function(x) sin(x) adaptIntegrate(integrand, 0, pi) 我可以从图库中按照这个配方从Rcpp调用这个R函数，但是从c / c ++到R来回切换会有一些性能损失。从C ++直接调用C函数似乎更合理。 C例程adapt_integrate从adapt_integrate导出 // R_RegisterCCallable(“cubature”, “adapt_integrate”, (DL_FUNC) adapt_integrate); 但是，我不明白如何从c ++中调用它。 这是我的跛脚尝试， sourceCpp(code = ‘ #include using namespace Rcpp; // [[Rcpp::export]] double integrand(double x){ return(sin(x)); } // [[Rcpp::depends(cubature)]] // [[Rcpp::export]] Rcpp::List integratecpp(double llim, double ulim) { Rcpp::Function p_cubature = R_GetCCallable(“cubature”, “adapt_integrate”); Rcpp::List […]
是否存在C / C ++的R编译器？
我想知道部署R的最佳方法.Matlab有“matlab编译器”（MCR）。 对R来说，过去已经讨论过将R编译成C或C ++的类似内容。 有没有人有任何由John Garvin在Rice开发的R to C编译器（RCC）的经验？ 我已经研究过它，它似乎是唯一一个将R代码编译成可执行代码的项目。 据我所知，它还没有被使用。 [编辑1：] ：要清楚，我知道有R和R（rJava，rcpp，Rpy等）的C和C ++（以及Java，Python等）接口。 我想知道在没有事先安装R的情况下编译和部署R代码的具体方法。 [编辑2：] ：John Mellor-Crummey告诉我，他们仍然在为RCC工作，并希望在4个月左右（最早）提供。 如果我发现其他任何问题，我会进一步更新。
